جعبه ابزار بیوانفورماتیک
در این مقاله جعبه ابزار بیوانفورماتیک (Bioinformatics Toolbox) در نرم افزار MATLAB را بررسی و ویژگی ها و کاربرد های این جعبه ابزار را به همراه داکیومنت انگلیسی آن در ادامه قرار داده ایم.
بیوانفورماتیک چیست
بیوانفورماتیک دانشی بین رشته ای است که شامل روش ها و نرم افزار های جهت درک و فهم بهتر اطلاعات زیستی می باشد. در واقع بیوانفورماتیک از ترکیب ریاضی مهندسی، آمار و علوم کامپیوتر جهت تجزیه و تحلیل و تفسیر اطلاعات زیست شناسی استفاده کرده و تجزیه و تحلیل درون کامپیوتری جهت حل مسائل زیست شناسی با استفاده از تکنیک های ریاضی و آمار را انجام می دهد.
معرفی جعبه ابزار بیوانفورماتیک
تولباکس Bioinformatics محیطی باز و قابل توسعه برای بیولوژیست های مولکولی و سایر دانشمندان فراهم می آورد که در آن می توان ایده های جدید، نمونه سازی الگوریتم های تازه و ایجاد برنامه های کاربردی در تحقیقات داروئی، مهندسی ژنتیک و سایر پروژه های مرتبط را انجام داد. جعبه ابزار Bioinformatics دسترسی به قالب های داده ای ژنومیکی و پروئتومیکی، روش های تحلیل و مصور سازی های خاص و مواردی از این دست را برای این مسائل فراهم می سازد. اکثر توابع در زبان MATLAB پیاده سازی شده اند و بنابراین امکان شخصی سازی آنها با استفاده از تغییر کدهای موجود وجود دارد.
ویژگی اصلی جعبه ابزار بیوانفورماتیک
- قابلیت های تحلیل و مصور سازی داده های میکرو آرایه ای
- پشتیبانی از تحلیل و پس پردازش طیف سنجی جرمی
- ابزار های تئوری و مصورسازی گراف ها
- قابلیت یادگیری آماری
- قابلیت هستی شناسی ژنی
- ابزار های تحلیل دنباله ای
- ابزار های تحلیل درخت تکامل نژادی
- قالب های فایلی ژئومیکی، پرو تئومیکی و بیان ژنی
- دسترسی به پایگاه داده
تصاویری از کاربرد جعبه ابزار بیوانفورماتیک
شکل ۱: پیش بینی و مصورسازی ساختار ثانویه توالی RNA
شکل ۲: نمودار پخش داده های میکرو آرایه ای
شکل ۳: پروتئومیت دیفرانسیل آزاد و تجزیه و تحلیل متابولومیکس
با سلام من آموزشی در مورد روش های مختلف بیوانفورماتیکی مثل طراحی دارو، طراحی واکسن، داینامیک مولکولی، داکینگ مولکولی، طراحی پرایمر و کلونینگ رو از کجا می تونم دانلود کنم ؟