قطعه بندی سلول ها از تصاویر اسلاید طیف جهت آسیب شناسی دیجیتال با نرم افزار متلب

قطعه بندی سلول ها از تصاویر اسلاید طیف

در این بخش پروژه قطعه بندی سلول ها از تصاویر اسلاید طیف با هدف آسیب شناسی دیجیتال را با استقاده از نرم افزار MATLAB و با عنوان مقاله Nuclei Segmentation of Whole Slide Images in Digital Pathology آماده کرده ایم که پروژه ای مناسب برای پردازش تصویر، بینایی ماشین، هوش مصنوعی و مهندسی پزشکی می باشد. در ادامه می توانید مقاله اصلی را به صورت رایگان دانلود و همچنین توضیحاتی در مورد پروژه، فیلم و تصاویری از خروجی شبیه سازی را مشاهده نمیایید.

تصاویر اسلاید طیف در آسیب شناسی دیجیتال

اسکن دیجیتالی اسلاید پاتولوژی یا همان آسیب شناسی از نوع دیجیتالی، مثالی از ظهور تصاویر اسلاید طیف می باشد که می تواند در تجزیه و تحلیل کمی نمونه های بافتی، یک دوره جدیدی باشد. این در حالی است که قضاوت هایی که توسط یک آسیب شناس و به صورت سنتی با الگوریتم هایی که در زمینه بینایی ماشین و پردازش تصویر ساخته شده اند، صورت می گیرد می تواند باعث تعیین مقدار پروتئین HER2 در سرطان پستان، تعیین تراکم سلولی در Neoplasm (نئوپلاسم) و سایر موارد دیگر شود.

آسیب‌ شناسی یا پاتولوژی (Pathology) چیست ؟

پاتولوژی یا آسیب شناسی به شاخه ایی از علم پزشکی گفته می شود که در ارتباط با تاثیر آسیب ها و بیماری ها در سطح مولکولی سلولی و همچنین بافتی بحث می کند. از نمونه های بافتی در اسلاید میکروسکوپ می توان به آسیب شناسی، معلول بیماری و مطالعه علت بیماری اشاره نمود.

چالش های آسیب شناسی دیجیتال

قطعه بندی دقیق سلول ها یکی از مهمترین چالش هایی است که در موضوع آسیب شناسی مطرح می شود. در نمونه هایی که از بافت ها تهیه می شود، سلول های موجود خیلی به هم نزدیک هستند و حتی در بعضی از جاها بر روی هم قرار گفته اند و در تصویر برداری علاوه بر آن که تصویر برداری به صورت سه بعدی انجام می شود، مشکل فشردگی سلول ها باعث می شود تا ما تصویر سه بعدی را به شکل یک تصویر دو بعدی ببینیم.

معرفی پروژه قطعه بندی سلول ها از تصاویر

در این پروژه که یک نوع پروژه پردازش تصویر می باشد، دسته ایی از الگوریتم های شناسایی هسته، قطعه بندی در هماتوکسیلین و همچنین ائوزین (H&E) با رنگ آمیزی کردن نمونه بافت با استفاده از نرم افزار MATLAB ارزیابی شده است.

الگوریتم های مورد استفاده در این پروژه قطعه بندی سلول ها از تصاویر

• الگوریتم تبدیل فاصله اقلیدسی
• اﻟﮕﻮرﯾﺘﻢ ﻗﻄﻌﻪ ﺑﻨﺪی واﺗﺮﺷﺪ
• ﺍﭘﺮﺍﺗﻮﺭ ﻫﺎﯼ ﺭﯾﺨﺖ ﺷﻨﺎﺳﯽ (مورفولوژی)
• فیلترهای گاوسین لاپلاسین
• آشکارسازهای MSER
• تبدیل هاف

---

---

تصاویری از خروجی